در زمان حاظر مزايا و فوايد استفاده از فناوري پيل سوختي به دلايل مختلف از جمله آلايندگي بسيار زياد سوختهاي فسيلي، محدود بودن منابع سوخت فسيلي و غيره واضح ميباشد. به اين منظور در اين مقاله به بررسي پيل سوختي كربنات مذاب و تاثير استفاده از دو جهت جريان(هم جهت و خلاف جهت) براي گازهاي ورودي در آند و كاتد پرداخته خواهد شد. به اين سبب با استفاده از نرم افزار COMSOL Multiphysics يك پيل سوختي كربنات مذاب شبيه سازي و با تغيير جهت گازهاي ورودي به تحليل خروجي پيل سوختي پرداخته ميشود. مدل مذكور ابتدا با استفاده از مقاله اي كه در آن نتايج تجربي نيز آورده شده]1[، اعتبار سنجي و سپس براي اعمال تغييرات مورد استفاده قرار گرفته شده است. در انتها نيز مشاهده شد كه در حالت جريان مخالف، افت ولتاژ و همچنين توان خروجي بهتري را خواهيم داشت