کشکول کتابی جُنگ‌مانند از شیخ بهایی شامل شعرها و نثرهای مورد علاقه او است.برخی از این شعرها و نثرها از خود وی و برخی نیز گردآوری او از دیوان‌ها و کتاب‌های مورد علاقه‌اش هستند. مطالب این کتاب، مضامین دینی، تاریخی، ادبی، ریاضی و نجومی دارند. این مطالب اغلب بی هیچ نظم خاصی به دنبال هم آمده‌اند. با این حال این اثر بیش از سایر تالیفات وی خواننده را به ضمیر فکری بهایی نزدیک می‌کند.نمونه متن کتاب کشکول شیخ بهایی:دفتر اول:تفسیر آیه ایاک نعبد و ایاک نستعین مفسران در تفسیر این آیه وجوه عدیده ای را مطرح کرده اند از جمله بهترین آنها چیزی است که در تفسیر فخر رازی آمده است و حاصل آن این است که در شریعت اسلام آمده است که کسی چند جنس را در یک معامله خرید و برخی از آنها معیوب در آمد، مشتری می تواند همه ی اجناس را پس دهد یا همه را نگهدارد و اینکه تنها معیوب ها را بر گرداند صحیح نیست. ( این عمل که تبعیض صفقه نامیده می شود، روا نیست ). در نماز نیز انسان عابد عبادت ناقص بهجا آورده است، آن را تنها به خدا عرضه نمی کند بلکه با عبادت جمیع عابدان از انبیاء و اولیائ و صالحان عرضه می کند و عرضه کلی موجب پذیرش عبادت او می شود چه اینکه حتما خدا همهع را با هم بر نمی گرداند و رد برخی همان تبعیض صفقه است و از آن نهی شده است پس خدا عمل او را نیز در ضمن عمل بقیه می پذیرد.بهشت یا مسجدیکی از ارباب حال روزی به یارانش گفت: اگر مرا مخیر کنند بین دخول در بهشت و دو رکعت نماز، نماز را تریح می دهم. گفتند: چرا؟ فرمود: من در بهشت به بهره خود مشغولم و در نماز به حق پروردگارم و این کجا و آن کجا.شبلی در خواباحیاء العلوم آورده است: کسی شبلی را پس از مرگش در خواب دید و به او گفت: خدا با تو چه کرد؟ گفت: با من مناقشه کرد تا بیچاره شدم. و چون مرا بیچاره دید در رحمت خود فرو برد. دیگران نیز او را بخواب دیدند و از حالش پرسیدند وی دو بیت شعر گفت که: با دقت به حساب ما رسیدگی کردند، پس منت گذاشتند و آزاد کردند این شیوه پادشاهان است که با مملوک آن مدارا کنند. حاسبو فدققوا ثم منّو فاعتقوا هکذا شیمه الملوک بالممالیک یرفقوا